Chegou a vez de Clank. O simpático robô de olhos verdes que acompanha Ratchet em diversas aventuras estréia como personagem principal em "Secret Agent Clank" que, como o próprio título dá a entender, faz uma paródia com os filmes de "007". O protagonista não apenas está trajado ao estilo James Bond, como também carrega uma série de "gadgets", ou seja, aqueles equipamentos tecnológicos das mais diversas utilidades.

Clank precisa ajudar Ratchet, que foi acusado de um crime que não cometeu, inocentando-o - e, para tal, entra em ação o seu alterego, Agent Clank. As fases mesclam seqüências de ação e minigames baseados em ritmo, além de cenas furtivas e de combates. Outros personagens, como Captain Qwark e o próprio Ratchet, também são personagens jogáveis ao longo da aventura. Outra aparição garantida é a de Giant Clank, a forma gigante e agressiva do robôzinho.

É claro que uma das partes mais promissoras de "Secret Agent Clank" são os já citados "gadgets", que incluem bumerangues em forma de gravata, bombas, uma caneta inflamável e botas que se transformam em jato. Veículos como um snowboard e um hovercraft garantem mais dinamismo entre uma missão e outra.

Clank pode aperfeiçoar seus movimentos de luta, o chamado "Clank-fu", em um esquema simular ao dos upgrades de armas nos games da série "Ratchet & Clank". E não são apenas novos golpes que ele aprende, mas também técnicas de finalização.